Solo una suposición descabellada...
... pero las diversas opciones largas deben especificarse usando -- , no - :
mongoimport --host localhost \
--db roudy123_q \
--collection LebaneseAmericanUniversity\(Lebanon\).json \
--file LebaneseAmericanUniversity\(Lebanon\).json \
--jsonArray
Tal vez esta versión particular de mongoimport es más puntilloso al respecto, y tratará -db ... -collection ... como argumentos posicionales en lugar de argumentos de palabras clave ?