Debe ejecutar una declaración de modificación de tabla para cada tabla. La declaración seguiría esta forma:
ALTER TABLE tbl_name
[[DEFAULT] CHARACTER SET charset_name]
[COLLATE collation_name]
Ahora, para obtener todas las tablas en la base de datos, debe ejecutar la siguiente consulta:
SELECT *
FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES
WHERE TABLE_SCHEMA="YourDataBaseName"
AND TABLE_TYPE="BASE TABLE";
Así que ahora deja que MySQL escriba el código por ti:
SELECT CONCAT("ALTER TABLE ", TABLE_SCHEMA, '.', TABLE_NAME," COLLATE your_collation_name_here;") AS ExecuteTheString
FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES
WHERE TABLE_SCHEMA="YourDatabaseName"
AND TABLE_TYPE="BASE TABLE";
Puede copiar los resultados y ejecutarlos. No he probado la sintaxis, pero debería poder averiguar el resto. Piense en ello como un pequeño ejercicio.
¡Espero que eso ayude!