Para cambiar el conjunto de caracteres de una tabla, desde Documentación de MySQL :
Si desea cambiar el conjunto de caracteres predeterminado de la tabla y todas las columnas de caracteres (CHAR, VARCHAR, TEXT) a un nuevo conjunto de caracteres, use una declaración como esta:
ALTER TABLE tbl_name CONVERT TO CHARACTER SET charset_name;
Si desea convertir una base de datos completa para usar un conjunto de caracteres predeterminado diferente, puede emitir esta declaración:(desde Conjunto de caracteres y clasificación predeterminados )
ALTER DATABASE db_name DEFAULT CHARACTER SET charset_name;