Hay pasos posibles para habilitar el incremento automático para una columna. Supongo que la versión de phpMyAdmin es 3.5.5 pero no estoy seguro.
Haga clic en Tabla > Estructura pestaña> Bajo Acción Haga clic en Principal (establecer como principal), haga clic en Cambiar en la ventana emergente, desplácese hacia la izquierda y marque A_I . También asegúrese de haber seleccionado Ninguno para Predeterminado