Tienes que cambiar el orden de tus índices:
CREATE TABLE IF NOT EXISTS `test` (
`id` int(10) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`abc` varchar(50) NOT NULL,
`data` varchar(100) NOT NULL,
PRIMARY KEY (`abc`, `id`) -- id got to be second
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1 AUTO_INCREMENT=1 ;
Cito del manual :
Para las tablas MyISAM, puede especificar AUTO_INCREMENT en un secundario columna en un índice de varias columnas.
Ejemplo de trabajo en este violín