Si entendí bien tu pregunta, quieres esos documentos que tienen los mismos valores en el campo 1 y el campo 2.
Para este intento
db.coll.find({$where: function() { return this.field1 == this.field2 } } );
o más compacto
db.coll.find({ $where : "this.field1 == this.field2" } );