Mongoose maneja conexiones a través de grupo de conexiones http://mongoosejs.com/docs/connections.html
Puedes usar server: {poolSize: 5}
opción para aumentar/disminuir el grupo (número de conexiones paralelas)
Si necesita conexiones a diferentes bases de datos, busque aquíMongoose y múltiples bases de datos en un solo proyecto node.js
Ejemplo de conexiones múltiples:
var mongoose = require('mongoose')
var conn = mongoose.createConnection('mongodb://localhost/db1');
var conn2 = mongoose.createConnection('mongodb://localhost/db2');
var Schema = new mongoose.Schema({})
var model1 = conn.model('User', Schema);
var model2 = conn2.model('Item', Schema);
model1.find({}, function() {
console.log("this will print out last");
});
model2.find({}, function() {
console.log("this will print out first");
});