El from El campo en $búsqueda es el nombre de la colección, no un nombre de variable de modelo. Entonces, si está inicializando el modelo de esta manera
db.model('User', userSchema)
entonces la consulta de búsqueda debería ser
commentModel.aggregate([{$lookup: {
from: 'users',
localField: 'author',
foreignField: '_id',
as: 'common'
}])
