Debido a las limitaciones de la excepción com.mongodb.BasicDBObject cuando se agregan varios criterios de consulta GridFSDBFile

Puede actualizar el método a continuación. Está intentando proporcionar múltiples $and operador con cada uno teniendo un criterio.

Por cierto, no necesitas un and explícito ing como mongodb proporciona and implícitos ing cuando los criterios están separados por comas.

public void getFile(Map<String, Object> metaData) throws Exception {
    Criteria criteria = new Criteria();
    metaData.forEach((k, v) -> criteria.and("metadata." + k).is(v));
    GridFSDBFile gridFSDBFile = gridFsOperations.findOne(new Query(criteria));
    if (gridFSDBFile == null) {
        throw new HttpConflictException();
}

En los casos en que necesite and explícitos ing, puede usar el siguiente código

public void getFile(Map<String, Object> metaData) throws Exception {
    Criteria criteria = new Criteria();
    Criteria[] andExpressions = metaData.entrySet().stream().
            map(kv -> Criteria.where("data." + kv.getKey()).is(kv.getValue()))
            .toArray(Criteria[]::new);
    Query andQuery = new Query();
    Criteria andCriteria = new Criteria();
    andQuery.addCriteria(andCriteria.andOperator(andExpressions));
    GridFSDBFile gridFSDBFile = gridFsOperations.findOne(andQuery);
    if (gridFSDBFile == null) {
        throw new HttpConflictException();
}