Asegúrese de que todos los servicios necesarios (por ejemplo, ssh, Apache / nginx, MySQL) en su servidor se inicien al arrancar. Si crea una AMI de su sistema, AWS apagará su servidor durante el tiempo que se lleve a cabo la creación de la imagen.
Así que ingrese a su instancia, eche un vistazo a la ejecución procesos y empieza las que te pierdas.